Si hablas de migrar sentencias (SQL) .. el foro indicado es el de Mysql (sub-foro del de "Base de datos").
El manual oficial de Msyql 5.x lo tienes en:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/
Y si tienes algún problema concreto con alguna sentencia SQL .. inicia un nuevo tema expón tu sentencia que te dá problemas y sobre todo recalca que funciona en tu versión 4.x y la quieres usar en 5.x
Un saludo,