yo pienso que tu consulta se ejecuta correctamente, a menos que te salga algun error, ahora sobre la consulta que realizas no hay nada ahi 'raro' como para decir que haya sido cambiado en mysql 5.0, ahora mas bien pienso que es problema con tu codigo php, has intentado usar otro metodo en vez mysql_fetch_object por que no pruebas con un mysql_fetch_array, bueno son sugerencias pero yo te aseguro que si copias tu consulta directamente a la base de datos te devuelve lo que esperas, y no ha cambiado nada, mas bien revisa tu php que eso parece el problema:
Código PHP:
<?
<div align="left"><font face="HandelGotDLig" color="#000000"><?= $data1->nit ?></font><font color="#000000"></font></div></td>
?>
prueba con los tags "<?= ?>" , bueno es cuestion de que pruebes, pero como te digo no me parece problema de mysql si no mas bien problema con php, cya