Cita:  
					Iniciado por OXIGENO  Luego hago un submit y comienza el trabajo de PHP para subir cada uno de los archivos... y obtengo las rutas completas de todos los archivos en un array... y los nombres de los mismos en otro array de PHP
(El formulario esta en modo POST y multipart/form-data).
    PHP *no hace ningún trabajo* ya que éste se ejecuta del lado del servidor, el encargado de *subir los ficheros* es el navegador. 
[
 Cita:  
					Iniciado por OXIGENO  ]Lo loco es que en localhost funciona de maravillas... pero cuando lo subo al server me da error...
  
Código:
 Warning: copy(C:\site\miarchivo.txt): failed to open stream: No such file or directory in /home/ov000004/public_html/_admin/import/subir.php on line 23
  Que por cierto... en la linea 23 esta el copy(origen,destino)
Vuelvo a reiterar.. en modo local funciona bien!.
   Sólo estás enviando las ubicaciones de los archivos y como están en la misma máquina, dá la impresión de que funciona de maravilla...; pero como te habrás dado cuenta eso no sirve. 
Lo *mejor* sería que uses/hagas un cliente de FTP o una aplicación de escritorio o consola que se encargue de subir los archivos (para esto me imagino que tienes que leer parte del protocolo HTTP). 
Saludos