No es cuestion de que esté mal, el problema es que lo que quieres hacer tarda demasiado en ejecutarse, tienes que modificar el TimeOut con la sentencia:
Server.ScriptTimeout= a un valor suficientemente alto como para que lo que quieras ejecutar no lo sobrepase. O cambias eso, o averiguas porque tarda tanto en ejecutarse lo que estes haciendo.
ciao