Duda Sobre "Diseño" De Web

[JoeCole]

Hola, me voy a poner ha hacer una web algo mas profesional de las que he hecho hasta ahora. Usare PHP, MySql y JavaScript en un principio. Hasta ahora cuando hacia una web, era para aprender y demas y no miraba mucho el como estaba hecha por dentro. Pero ahora quiero que las tripas de la web tambien este bien desarrollado y por eso quiero pediros consejo. Mi duda esta en como realizar las paginas en php. Cuando yo necesitaba mostrar una informacion en PHP segun una variable que se pasase, lo que hacia era una unica pagina con diferentes IF (Paginas con hasta 10 IF) y en funcion de la condicion que se cumpliese pues leia todo el codigo y mostraba por pantalla. Y lo que no se si esta es la forma correcta o es mas correcto el hace por ejemplo 10 paginas diferentes y en funcion de la variable pasada que se carge una o otra. Es decir mi duda radica en..¿Todo en un archivo PHP? o ¿Utilizar varios archivos PHP?
No se si ha quedado clara la explicacion...

Un saludo y gracias