Lo que pasa es que el e-mule se basa en un sistema de "creditos", para no hacer grande el choro, resulta que entre mas subes (o entre mas te bajan) mas puedes bajar tu, bueno, eso es lo que tengo entendido.
Segun mi experiencia, para que el emule realmente funcione bien, es decir, que tengas una velocidad de descarga aceptable, entre mayor tiempo este conectado, es mejor, por ejemplo, una vez escuche de un usuario que llevaba como 3 meses con su compu prendida (y con su emule corriendo), y pues creo que a el si le bajaba bien. xD
Pero de todos modos, puedes checar las FAQs del emule, para que cheques lo que te digo y puedas aclarar un poco mejor tus dudas, aqui te dejo el link de los creditos:
AQUI