Para google tu tienes un enlace desde el sitio donde le pones el enlace, ni mas ni menos. Para ke kede claro supongamos dos dominios:
www.d1 y
www.d2 si tenemos un pagina index.htm con iframes en el raiz del dominio d1 (
www.d1/index.htm) y en dicho iframe abrimos una pagina llamada page.htm del dominio d2 (
www.d2/page.htm) donde estan los enlaces, para google & cia los enlaces estan en
www.d2/page.htm y no en
www.d1/index.htm