Cita: lo que no se es como capturar los que el no selecciona si sabes me cuentas??
Por definición .. los checkbox que NO seleccionas no pasan como variables (o como indices de ese array que generamos) al script PHP de proceso.
Pero .. Si tu generas esos checkbox en función de una consulta SQL a tu BBDD o por otro médio .. sabes entonces cuantos "elementos" tienes en total y cuales son. Como también sabes cuantos "seleccionastes" y cuales son los que no has seleccionado.
Un saludo,