Lo que tienes que hacer es ponerle un tamaño para el ancho del label si no no funcionara, o poner el label dentro de una tabla y alinear la celda, pero si lo que quieres es solo usar un label
Código:
<asp:Label id="Label1" runat="server" Width="300px" style="TEXT-ALIGN:right">Label</asp:Label>
'Codigo
Label1.Text = Format(95678.987, "##""'""###.000")