El concepto es diferente a lo que mencionas tu como "insertar" .. Se trata de que con PHP -vas- a generar ese código HTML/Javascirpt resultante .. nada más que eso .. ni PHP "carga" nada en javacript ni lo inserta.
No sé cual es tu objetivo (ejemplo del código javascirpt y donde debes aplicar "PHP" en ese proceso). Pero .. según la descripción de lo que PHP hace .. sería (un ejemplo básico):
Código PHP:
<?
$variablePHP="blablabla";
?>
<script languaje="javacript">
var variable_javascript="<? echo $variablePHP ?>";
alert (variable_javacript);
</script>
Si te fijas en tu navegador (código fuente) al ejecutar tu código .php .. vas a generar una página tal que:
Código:
<script languaje="javacript">
var variable_javascript="blablabla";
alert (variable_javacript);
</script>
Y eso es lo que -finalmente- ejecutará tu navegador como cliente que es (y por qué tu navegador "entiende" ese javascript a interpretar).
Un saludo,