Si no me equivoco el Mysql Query Browser solo viene es una aplicacion para ejecutar consultas, no tiene la capacidad de sacar dumps de bases de datos, esto lo puedes hacer directamente desde una consola de DOS, con mysqldump, ahora si te gusta el
mysqlFront puedes bajarte la ultima version, que viene con soporte para mysql 5, ahora tambien puedes usar otros GUIs, ..
SqlYog Navicat Toad
saludos... cya