Los valores deberias manejarlos como números sin los puntos que separen los miles y al momento de mostrarlos por pantalla darles formato. Para eso podrías utilizar la función
number_format():
Código PHP:
<?
$a=12500;
$b=10000;
$monto_final= $a + $b;
echo "El monto final es: ".number_format($monto_final);
?>
Saludos.