Si lo exportas a DVD es normal que te cree 2 archivos. (que no son VCD)
Si lo exportas a VCD (mpeg-1) solo te crea 1.
Si lo exportas a DVD y luego lo quieres pasar a VCD no tiene caso, mejor exporta directo a VCD.
Si aún así lo quieres hacer de esa manera Debes multiplexar los dos archivos creados usando TMPGEnc por ejemplo, y dándole el formato mpeg-1
Y si lo quieres para internet, recomeiendo que lo pases a WMV directo después de la edición.