independientemente de que sea un duplicado de contenido o no, es perjudicial. porque tu nunca puedes evitar que a alguien le gusta tu web y te hace un enlace a tudominio.com/index.php cuano otro te enlazará directamente a tu dominio.com. si bien hay dudas sobre si es duplicado o no, no cabe duca de q el PR se divide en 2 direcciones.
evita el accesi sin www poniendo esto en la raiz:
y luego redirecciona dominio.com/index.php a dominio.com/ poniendo eso:
Cita: RewriteCond %{THE_REQUEST} ^[A-Z]{3,9}\ /.*index\.php\ HTTP/
RewriteRule ^(.*)index\.php$ /$1 [R=301,L]
.
en tu caso el segundo código lo debes poner dentro de la carpeta ipb.
suerte