Lo he solucionado mas o menos asi:
<documento>
<clasificacion> Industrial. </clasificacion>
<parrafo> fadsfjashdifahs </parrafo>
<url>
http://www.xxxxxxx.xxx </url>
<parrafo2> sadfasdfadsf</parrafo2>
</documento>
<xsl:template match="parrafo2">
<fo:block space-after="0pt" space-before="0pt">
<fo:basic-link color="#0060A0" external-destination="{../url}">
<xsl:value-of select="."/>
</fo:basic-link>
</fo:block>
</xsl:template>
Con lo que creo un enlace en parrafo2 a la direccion de la etiqueta url.
Hago notar el ../url. Es decir, vuelve a referenciar documento y luego bajo el nivel otra vez a url en el arbol xml.