Me dice:
 mv: cannot overwrite directory `../Carpeta' 
Donde "Carpeta" existía en el directorio destino, pero presisamente es la que quiero sobreescribir... 
Los archivos sí fueron movidos, solo pasa eso con cada carpeta duplicada. ¿cuestión de permisos?. 
Nota: Estoy moviendo efectuando la acción en un servidor remoto a través de SSH. 
Gracias por la ayuda