Pero .. que es lo que no te "convence" ...
Los conversores HTML2PDF según el HTML que tengas .. a veces no dan buenos resultados (sobre todo con tablas HTML anidadas ...).
La generación del PDF completo en forma dinámica con ayuda de alguna classe tipo FPDF son buenas, .. los resultados van en función del tiempo que le dediques a generar tu PDF con tu formato "a mano" ...
Otra cosa que podrías probar es un generador de reportes como
Agata Reports
http://www.agata.org.br/
Genera PDF's entre otros formatos de salida ...
Un saludo,