Código!!! Adivinos no somos... pero es un hecho que estas haciendo algo mal.
Supongo algo como esto:
Código PHP:
<?php
// comentario PHP; no se imprime
?>
// comentario PHP; sí se imprime (no estás "dentro de PHP").
<?php
// Quizá, siendo extremistas...
echo " blablablalbalba<br>
// comentario PHP
";
?>
La situación es que "no hay explicación" a tu error porque no es "una situación de PHP" sino "algo" que definitivamente estás haciendo mal.