Muy sencillo.
Arranca el w2000 y vete a Mi Pc -->Boton derecho (BD) --> Propiedades --> Avanzado --> Inicio y recuperación.
En la casilla de "sistema operativo predeterminado" elige tu w2000 profesional y desactiva el check de "mostrar lista de sistemas operativos" para dejar a 0 el numero de segundos.
El menú de arranque que instala w2000 no se puede quitar, lo mejor es trucarle como hemos hecho para que coja por defecto el w2000 y lo arranque sin más. Todos estos cambios se guardan dentro del fichero boot.ini que es el que guarda la configuracion del menu de arranque.
Asi cuando tu eligas la opcion de w2000 en Bootmagic veras como no aparece el molesto menú.
Un saludo.