Totalmente aclarado, perdona pero entendi mal tu pregunta, por que no revisas el siguiente link, a mi me ayudo bastante cuando kise hacer algo semejante:
http://www.forosdelweb.com/showpost....&postcount=125
Este codigo es para cuando deseas ejecutar una aplicacion externa y esperar a que termine para continuar en tu aplicacion en vb.
Sorri
Saludos