Hola, The_Pretorian:
Te puedo decir, que las ventajas del Mysql 5 / Mysql 4 son muy notables.
1. Store procedure (Procedimientos Almacenados).
Esta caracteristica no es más que Rutinas que guardas en la Base de Datos. Estas rutinas simplementes las llamas desde un programa Cliente y estas se ejecutan dentro de la Base de Datos.
2. Vistas:
Las vistas son excelentes, puedes almacenar un QUERY dentro de la base de datos y ejecutarla con una simple llamada. Ejemplo:
Suponte que tienes un query que es muy largo y que debes usar muchas veces en tu aplicación en varios modulos.
Código PHP:
SELECT tabla1.campo1, tabla1.campo2, tabla2.campo1, tabla2.campo2 FROM tabla1
INNER JOIN tabla2 ON tabla1.campo1 = tabla2.campo 2
WHERE campo1 > 0;
Ahora solamente almacenas ese query en la base de datos y le colocas un nombre:
tabla1_tabla2. Una vez que tienes esto puedes entonces llamar a ese query asi:
Código PHP:
SELECT * FROM tabla1_tabla2;
Esto para mi ha sido de gran ayuda, ya que he tenido que usar querys de más de 4 lineas, y realmente esto me ha quitado mucho ruido visual en mis scripts PHP.
3. Trigger.
Estos son eventos que se producen cuando haces un UPDATE, INSERT ó DELETE en una tabla. Por ejemplo puedes hacer que cada vez que se inserte un registro en tabla1, se ejecute un procedimiento almacenado que haga una tarea especifica con esos datos nuevos en la tabla.
Bueno estas son las caracteristicas nuevas, ahora recuerda que la version MYsql 4.1.x ó posterior permite sub-consultas.
Con respecto a instalar las 2 versiones, lo dudo, ya que la libreria cliente a partir de la version 4.1.x cambió y da conflictos.
Dale un vistazo a
http://www.mysql-hispano.com.
Suerte... Te recomiendo que cambies a Mysql 5