justamente me referia a lo gatorv menciona, no importa lo que hagas del lado del servidor, para un navegador comun y corriente tiene que ser html (sea este generado por javascript o no...) y javascript (puede estar ofuscado) valido
si dudas de lo que te digo, mandame la direccion de tu pagina cuando creas haber "encriptado" tu html
actualizacion: me parece acertado tu ultimo mensaje