Por lo que alcanzo a ver usas FPDF sólo.
En ese caso si te fijas bien en la documentación de FPDF veras que hay un método que se llama: multicell() que hace lo que pretendes, permite justificar el texto sobre la celda (tamaños definidos) y hace un "wordpad" (salta línea si no cabe en lo definido el texto ..)
multicell()
http://www.fpdf.org/es/doc/multicell.htm
Un saludo,