Antes de PHP esta HTML... que es "texto normal" con ciertas normas, es con HTML con lo que se contruyen los enlaces.
Código PHP:
$url= "http://www.google.com"; dato que puede provenir de donde sea (la BD incluida)
echo "<a href=\"$url\">Enlace</a>";
PHP solo genera código que es utilizado por el cliente. Si tienes problemas con HTML (JavaScript, CSS, etc.) lo mejor sería que solucionaras eso antes de meterte con PHP.
Saludos y suerte!