es cierto que el explorer 6 hace algunas cosas raras respecto al 5, pero no con variables de sesion que yo sepa, sino que lo hace con las cookies.
en el explorer 5 si tu escribias una cookie y no le dabas fecha de expiracion, esta vivia mientras tenias el explorer abierto o alguna ventana abierta.
pues con el explorer 6 si tu escribes una cookie y no le das fecha de expiracion esta vive solo en la misma ventana desde la que se escribio, osea, que si haces un window.open la cookie que escribiste en la "madre" ya no vive en la nueva.
