Para que te hagas una idea PHPMailer no es más que un "montón de código" PHP, que vá "encapsulado" en lo que se denomina "classe" pues está programado "orientado a objetos" (
www.php.net/oop) .. pero, en general no es más que código PHP.
Se usa como su documentación explica .. tu incluyes la "classe" (include(".....")) y llamas a sus métodos como los ejemplos y tutoriales describen. Nada más que tocar en tu "php.ini" ni parecido.
Si vas a enviar el e-mail por SMTP (el "mailer=SMPT") en ese lugar sólo tendrás que tener a mano una dirección de correo tipo SMTP con su "host" (smtp.tal.tal o similar) y sus datos de conexión (usuario/contraseña)
Un saludo,