script termina inexperadamente

[chuscazo]

Hola, siempre he programado mis php sobre linux, ahora lo estoy haciendo sobre el xampp de apache friends sobre windows. El caso es que tengo un script que puede tardar 2 o 3 horas en ejecutarse y que realiza consultas a un sql server he introduce datos en un Mysql.

Tengo que analizar alrrededor de 26.000 elementos, y mi script solo llega alrededor de los 4.000. Los elementos los cojo de 1000 en 1000 para no ocupar mucha memoria y ademas libero siempre los resultados cuando acaba el bucle. De cada uno de esos 100 elementos tengo que cojer otros datos de otra tabla que no pasaran de 30 registros como mucho. Inicializo las variables que crecen dentro del 1er bucle siempre en la primera vuelta. Y si solo hago la primera consulta si que obtengo los 26.000 elementos.

Mi problema radica en que el script solo llega cerca de los 4000, no siempre se para en el mismo elemento, y el php no me saca ningun error, tampoco encuentro nada en apache.logs ni en mysql.logs. Ya he buscado tambien la directiva max_execution_time de apache, pero no esta en mi http.conf (hay algun por defecto aunque no este la directiva?), he pensado que puede ser algo del maximo tiempo de ejecucion pero como 'nadie' me saca un error no lo puedo saber, o al menos yo no he encontrado donde se guarda ese error.

El S.O. es el Win2003.

Alguien me puede ayudar??

Saludos y gracias.