Podrías leer el capítulo correspondiente al "upload de archivos múltiple" de PHP.net:
http://www.php.net/manual/en/feature...d.multiple.php
Ahí veras que el array $_FILES (superglobal) se trata como un array (de más dimensiones) para poder tener N "files" en tu formulario HTML y así tratarlos en tu script PHP.
Un saludo,