Sighs.... toda la pagina de "flash site" esta en flash? o solo la cabezera?, en las plantillas normalmente solo la cabezera esta en flash, con lo que seria cuestion de tomar el html como cuerpo de la pagina, insertar alli un buscador, y la cabezera queda con el flash, pero si no tienes idea, seria mejor que alguien te de la mano personalmente
Por cierto este tema no va aca, sino en "Web general"