Hola
Si quieres eliminar un audio te puede servir esto:
www.mundodivx.com/mpeg/previampg.php (el caso de audio dual)
De todas formas si eso no funcionam bájate el gspot 2.52 ó 2.60, abres con él tu AVI, y le sacas una captura de pantalla de los datos que salen, esa captura ponla por aquí para que pueda ver qué caracteristicas tiene tu AVI.
Saludos