Yo lo hago así: En el Solution Explorer del proyecto web le hago un copy proyect. Luego, me copio todo el directorio que generó el copy proyect y ese lo pego en C:/Ineptub/wwwroot/ (directorio virtual por default) o en cualquier otra ruta.
Luego me voy al internet information services y creo el directorio virtual para la ruta donde está el proyecto y ya puedo disfrutar de la aplicación web