Cita: Lo de usar ftp me parece interesante sin embargo habria que ver la manera de automatizar esto de modo que el usuario no intervenga tanto en la ejecución.
Podrías automatizar el proceso corriendo ese proceso por ejemplo una vez al día .. todo lanzado con un "cron job" (linux) o equivalente para windows (depende de tu S.O. de tu servidor).
Cita: Por otro lado, asi como existe la necesidad de actualizar ficheros (.php) tambien hay necesidad de actualizar la estructura de la DB, y esto hay que hacerlo sin que afecte la data creada por el usuario. Espero sugerencias.
Esto es más complicado .. sobre todo cuando dices que "se acutalizará la estructura de la BD" .. ¿por qué debes actualizar la estructura de tu BBDD? .. Tal vez un "mal" diseño de tu modelo de datos te haga hacer eso .. pero lo "normal" es que no sea así .. sólo "añadir" datos o cambiar "datos" (registros) en un modelo de datos tal vez más complejo. Así no afectaría para nada este tipo de actualizaciones .. sobre todo fijtate en el instante que hagas la actualización .. como contralas que ningún usurio esté usando tu aplicación? .. Y lo mismo pasa con código PHP .. ¿por qué debes actualizarlo también? .. por qué te cambió la estructura de tu BBDD? .. Esto realmente no debería ser así. Si llegas a optimizar esta parte .. no tendrías por ejemplo por qué actualizar ".php" (scripts) ni la estructura de la BBDD .. sólo "datos" que ingresar nuevos tal vez o cambios .. pero no cambios tan "drásticos".
Un saludo,