Puedes usar el siguiente codigo en el index:
 
<frameset rows="100,*,120">
<frame name=encabezado src="encabezado.html">
<frameset cols="180,*">
<frame name=izquierdo src="izquierda.html">
<frame name=contenido src="contenido.html">
</frameset>
<frame name=pie src="pie.html">
</frameset> 
esto crea una disposicion como la siguiente:   
Código:
 ------------------------------
|        encabezado            | 
------------------------------
|     izq   |     principal    | 
------------------------------
|             pie             | 
------------------------------
  luego extraes el codigo de cada seccion de la plantilla y las colocas en 
los archivos de cada frame: encabezado.html, pie.html, ... o con el nombre que prefieras