No, no bastaria. Las aplicaciones JWS son capaces de usar librerias nativas de forma remota, pero los applets no.
Pero mientras sea para PCs controlados donde puedas instalar JavaX Comm, los certificados del applet y el java.policy, no será un problema. Yo hice así un applet que se comunicaba con una impresora de libretas de ahorros y funcionó. No funciona para el caso general, pero si no es el tuyo... ¿que más da?
