Las variables que se pasan por la url, se guardan en $_GET.
Una url de tipo pagina.php?variable=XXX
Generará $_GET['variable'], con un valor de 'XXX'
Para usar number_format, lo ideal es leer la página del manual:
http://www.php.net/number_format
Para cambiarlo entonces, lo único que tenés que hacer es, en el lugar donde querés que aparezca:
<?php echo number_format($_GET['variable'], los parámetros que necesites, fijate en la página del manual); ?>
Saludos.