Hola:
El contenedor inmediato se llama parent, o sea que debes usar:
parent.funcion_javascript();
Tengo una página donde hay una relación recíproca entre la página principal y unos cuantos iframes:
Gradientes (php + librerías GD), donde cada control deslizante es un iframe, y las coordenadas los refleja en el formulario correspondiente y modifica el color resultante en el cuadro adyascente.
Saludos