Hola:
Me parece que estás confundido... showModalDialog es un "invento" microsoft "no estándar"... y las ventanas tienen un aspecto tal vez distinto, pero no se trata de ventanas modales... Las realmente estándar son las que se abren con alert, confirm y prompt y no pueden configurarse...
Si sigues interesado en usar showModalDialog te recomiendo que veas la librería msn porque solo funcionan con navegadores basados en explorer...
Saludos