Colócale un identificador al iframe (atributo ID) y recurre al DOM (Document Object Model) para manipularlo:
Código:
//HTML
<iframe src="iframes3.php" name="iframe" id="iframe"></iframe>
//JS
<script type="text/javascript">
miFrame = document.getElementById("iframe");
alert(miFrame.scrollHeight);
alert(miFrame.offsetHeight);
miFrame.style.backgroundColor = "red"
</script>