Hola, pues lo que creo entender espero y te ayude lo siguiente.
No se mucho de PHP pero me imagino que ha de existir alguna función en PHP que busque la coincidencia de un caracter entonces podrias buscar la coincidencia del 'PUNTO''.' para asi poder manipular los string y delimitar lo que quieres guardar en tu arreglo. espero y te sirva de algo esta humilde idea.
