Hola Master,
No he trabajado php con SQL Server pero sí con Access. Y lo único que necesitas es trabajar en el llamado y todo lo referente, con una conexción de tipo ODBC (Open Database Conectivity) Estas se crean en el S.O Windows y solo tiene eso de diferente.
Otra opción es usar una conexión hecha por un string con los datos de sql server, etc., activando algunas cosas en el php.ini
Un ejemplo de esto último :
http://www.webestilo.com/php/articulo.phtml?art=19
Saludos.