¿Te pasa sólo con un vídeo? Si puedes abre ese vídeo en GSpot, haz una captura de pantalla para ver los datos, y me la pones en tu respuesta. Pues puede ser simplemente que tu vídeo use alguna característica incompatible con los reproductores como el Qpel o el GMC. Es muy raro que no te soporte DivX 6 pues como ya te digo es el mismo que DivX 5 pero con otra apariencia.
Si aun así quieres convertirlo, puedes usar Auto Gordian Knot:
www.mundodivx.com/dvdavi/autogk.php Te recomiendo hacerlo de divx a xvid, en todo caso.