Como veo estas usando la libreria
FPDF.
Como dice
Nano_Asi, Asi es para Guardar el Archivo, debemos agregarle los argumentos a la funcion Output.
De todas formas crear PDF con un poquito de estilo con FPDF es un medianamente complicado ya. Por lo tanto te recomiendo una libreria llamada
TCPDF la cual se basa en FPDF, y tiene muchas mas funciones agregadas que FPDF, una de las llamativas es que reconoce tags XHTML valido y permite crear facilmente archivos PDF con negritas, titulos,colores,tablas e incluso imagenes (con tags html), y soporta UTF-8 ( vamos a tener problemas con acentos,tildes,la ñ,etc ..).
Aqui tengo un Articulo
Crear PDF con TCPDF donde utilizamos la Clase TCPDF y podemos crear PDF para que se Descargen en el Navegador o Guardarlos en el mismo Servidor.
Ojala te sirva.
Saludos