Cita:
Iniciado por Neotantra 
Las páginas de un sitio, están todas en una IP, los subdominios con sus páginas también. Los buscadores indexan páginas, no sitios. Por lo tanto básicamente no perjudica.
Según esta guía de posicionamiento hay un consenso promedio según varios expertos SEO en que sí puede influir negativamente en el posicionamiento, aquí dejo el vínculo
http://www.seomoz.org/article/search-ranking-factors
y busquen por "Shared IP Address" para encontrar la nota.