Hola, lo que te recomiendo es utilizar un software de edición de audio, son muy fáciles de utilizar y podrás editar tus sonidos, lo que deseas hacer es mas que sencillo con un programa de edición ya que puedes eliminar los espacios vacíos o en silencio. Estos programas te muestra el sonido en forma de ondas y reconoces el silencio o espacio porque no tiene forma. Te recomiendo el siguiente programa que es excelente y muy fácil de usar
www.goldwave.com