FTP es un estándar, o sea, si lo usas a modo comando o utilizando un utilitario gráfico, van a hacer exactamente lo mismo.
Si investigas sobre los comandos FTP e investigas lo que hace un programa gráfico de FTP, te vas a dar cuenta que hace exactamente lo mismo solo que en ves de escribirlo, está programado por una tecla.
Otra cosa, es muy diferente un servidor FTP y un cliente FTP. Leyendo tu consulta, lo que necesitas es un cliente FTP y para eso, lo que podes usar es el internet explorer, firefox, opera, o lo que sea para navegar por internet, simplemente escribes
ftp://sitio y listo.