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Iniciado por Nexus_ 
Ya he probado, el problema es que luego para el query hago un str_replace para hacer una consulta del tipo WHERE ciudad in ('valencia','la coruna',...) y si hago el str_replace de %20 me toma 'la coruna' como dos cosas separadas.
Ya intentaste con la función explode? o quiza split usando expresiones regulares evite los errores.