Cuando digo... "Mientras vas pintando el listado de usuarios (que ya dices que lo tienes), por cada usuario chequeas su directorio asociado" me refiero a esta porcion del codigo. Dentro de ese while es que debes ir chequeando los directorios, por ejemplo chekdir($row["directorio"]); donde checkdir es una funcion creada por ti para averiguar el peso de dicho directorio.
Código PHP:
while ($row=mysql_fetch_array($cnx))
{
$nombre = "".$row['nombre']."";
$apellidos = "".$row['apellidos']."";
$email = "".$row['email']."";
//
$peso = chekdir($row["directorio"]);
//
echo ("".$apellidos.", ".$nombre." -".$email."-".$peso."-");
}
Si ya conseguiste obtener el tamaño de un directorio, solo debes colocar tu funcion mas arriba donde te indique.
Saludos.