Quizas sea porque estas indicandole el nombre de la carpeta pero no el del archivo en realidad, FileNOtFoundExeption quiere decir que no encontro el Archico, Prueba ubicando el archivo dale click derecho en el Archivo en Propiedades copia la ubicacion y agragale el nombre del archivo. Deberia quedar algo asi:
Código:
Shell("C:\Documents and Settings\ADMIN\Desktop\MyFile.exe", vbNormalNoFocus)