Ninguna pregunta es tonta, el que la hace si , xD xD xD xD hahahaha broma broma :P (eso dijo una vez un profe xD)
La verdad el que es tonto, es el que jamas pregunta
Bueno si tienes plantillas, me imagino que estas usando Templates , una buena clase para manejar Template de php de manera Facil es Smarty
Php Smarty : Usando Matrices
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Ahora si estas usando web modulares , como include el header de la pagina, despues el footer, etc ... tendras q aplicar a todos los scripts que quieras que luzcan igual
Saludos