Al fin la solución estaba delante de mis narices y no la había probado.
He puesto la función Javascript en el <head> y le he pasado los parámetros necesarios:
Código:
<script language="javascript">
function verifica_borrado(idevento,idmuestreo){
if (confirm("Por favor, confirma que quieres borrar\nel evento "+idevento+" del muestreo "+idmuestreo+"."))
window.document.location.href="borrarevento.php?idmuestreo="+idmuestreo+"&idevento="+idevento+"";
}
</script>
y la llamada la hago pasandole los parámetros en el do while:
Código PHP:
onClick="verifica_borrado(<?php echo $row_RS_eventos['idevento']; ?>,<?php echo $row_DetailRS1['idmuestreo']; ?>)
Gracias de todos modos...